Кафедра Церковной истории — учебно-научное подразделением Московской духовной академии. Кафедра готовит специалистов высокой профессиональной квалификации по профилю кафедры, подготавливает научно-педагогические кадры и повышает их квалификацию, (в т.ч. высшую квалификацию через аспирантуру) на основе единства учебно-методической и научной работы.

Приоритетное направление деятельности Кафедры —  организация и проведение научно-исследовательской работы, координация научных исследований, ведущихся на кафедре; разработка тематики дипломных, магистерских и кандидатских работ; руководство научно-исследовательской работой студентов, включая, обеспечение руководства аспирантами.

Кафедра занимается публикацией научных исследований профессорско-преподавательского состава и студентов. Планируется издание на регулярной основе научного журнала «Церковный историк».

Актуализация и апробация научных знаний и исследований проводится путем участия профессорско-преподавательского состава, сотрудников кафедры и студентов в работе семинаров, конференций, симпозиумов, научных обществ, как создаваемых и созываемых самой кафедрой, так и по приглашению других учебных, научных и исследовательских заведений.

Для реализации конкретных научных и исследовательских проектов Кафедра создает рабочие группы, в случае необходимости привлекая к их работе специалистов с других кафедр МДА и сотрудников иных учебных или научно-исследовательских заведений.

В качестве основного направления исследований наша кафедра заявила создание научной школы «История Русской Церкви в событиях и персоналиях». Среди исследований, авторами которых являются члены нашей кафедры и работ наших питомцев, представляемых к защите, – труды по персоналиям, по истории епархий, храмов и монастырей России и русского зарубежья, по истории церковно-государственных отношений, по историографии, по истории подвига новомучеников и исповедников Церкви Русской. Особое место занимают работы, посвящённые истории Московской духовной академии. Важными являются и исследования по истории Древней Руси и западных исповеданий.

Современную структуру кафедра обрела в 2004 году в результате реформы высшего духовного образования Русской Православной Церкви. Особый рост влияния кафедры на учебно-научную жизнь академии напрямую связан с произошедшим углублением специализации академических программ и организацией церковно-исторического отделения Академии.

В настоящее время на кафедре трудятся 6 профессоров, 6 доцентов, 3 старших преподавателя и 3 преподавателя. Среди них – опытные педагоги с многолетним опытом работы, признанные в учёном мире авторитетные исследователи и начинающие труженики на ниве духовного образования и церковно- исторической науки.

Члены нашей кафедры обеспечивают преподавание на бакалавриате и в магистратуре Московской духовной академии следующих дисциплин: История Церкви, История Отечества, История Древней Церкви, История Русской Православной Церкви, История западных исповеданий и сравнительное богословие, Новейшая история западных исповеданий, История Поместных Церквей, Католическое богословие после Второго Ватиканского Собора, История Католической Церкви, Историография церковной истории, Церковно-государственные отношения в ХХ веке, Актуальные проблемы изучения истории России, История античного мира, Вспомогательные исторические дисциплины, Актуальные проблемы изучения истории Церкви до 1054 года, Агиография и агиология, Источниковедение и архивоведение, История старообрядчества, Методология исторической науки. Кроме того, кафедра организует и проводит стационарные и выездные практики. Кафедра осуществляет разработку новых курсов и факультативов исторической специализации, а также совершенствование и обновление базовых дисциплин.

Длительные и конструктивные отношения связывают нашу кафедру с Институтом археологии Российской Академии наук, с Музеями Московского Кремля, с Государственным историческим музеем, с Российским государственным архивом древних актов, с Государственным архивом Российской Федерации, с профильными кафедрами духовных и светских учебных заведений, с образовательными и просветительскими структурами епархий Русской Православной Церкви.

Руководство деятельностью Кафедры осуществляет заведующий Кафедрой Церковной Истории. Данную должность с 1 сентября 2004 года занимает профессор Алексей Константинович Светозарский. Методист Кафедры Церковной Истории – Роман Владимирович Булдаков.