Кафедра церковно-практических дисциплин Московской духовной академии была учреждена в 2004 году в процессе реформы системы духовного образования Русской Православной Церкви. Заведующим кафедрой со времени ее основания и до конца декабря 2018 года являлся профессор протоиерей Владислав Цыпин. C 2019 года   заведующим кафедрой является протоиерей Александр Задорнов. Предшественницей кафедры была комиссия церковно-практических дисциплин, образованная в середине 60-х годов XX века. Комиссию возглавляли известные профессора Московской духовной академии: протоиерей Александр Ветелев, игумен Марк (Лозинский), А.И. Георгиевский и архимандрит Матфей (Мормыль).

Особенность кафедры церковно-практических дисциплин заключается в том, что она объединяет специалистов по различным церковным наукам: пасторологии, литургике, каноническому праву, миссиологии, церковному пению и др. Силами кафедры осуществляется преподавание около 47 дисциплин и практик в бакалавриате, магистратуре и аспирантуре. Кафедра обеспечивает осуществление основных образовательных программ высшего образования по направлениям подготовки:

• 48.03.01 Теология, профиль «Практическая теология Православия» на бакалавриате;
• «Подготовка служителей и религиозного персонала религиозных организаций», профиль «Современное каноническое право» в магистратуре.

Деятельность кафедры церковно-практических дисциплин, как и всей академии в целом, ведется в условиях перманентной реформы академического и семинарского образования. В ходе реформы в учебные планы бакалавриата, магистратуры и аспирантуры были введены новые дисциплины. Преподаватели, которым поручалось преподавание новых предметов, спецкурсов и практик, разрабатывали программы, которые проходили апробацию на заседаниях кафедры. Члены кафедры входили в состав рабочей группы по разработке концепции новой системы богословского образования, участвовали в составлении и обсуждении документов, связанных с осуществлением реформы.

Кафедра осуществляет также экспертную работу по запросам Святейшего Патриарха и Священного Синода Русской Православной Церкви. По поручению священноначалия преподавателями кафедры составлялись справки и проекты документов по каноническим, богослужебным и пасторологическим темам, в частности, в связи с деятельностью Межсоборного присутствия.