МДА вошла в список вузов, проходящих в 2025 году процедуру независимой оценки качества образования. Проверка проходит с 17 февраля по 30 мая 2025 года.

2 апреля 2025 года в рамках заседания студенческого научно-богословского общества «Православная паулинистика» студент 1 курса магистратуры Николай Харитонов выступил с докладом «Исторический контекст учения о властях в Послании апостола Павла к Римлянам (13:1–7)».

1 апреля 2025 года ректор МДА епископ Кирилл благословил на вступление в брак четыре пары и вручил им памятные подарки.

16 мая 2025 года кафедра богословия МДА проведет день открытых дверей, где будущие абитуриенты смогут познакомится с образовательной и научной деятельностью кафедры. Начало в 14:30.

14 и 15 мая 2025 года состоится весенняя сессия конференции кафедры библеистики «Экзегетика и герменевтика Священного Писания в свете православного Предания», в которой примут участие преподаватели и учащиеся аспирантуры, магистратуры, бакалавриата МДА, а также других высших богословских учебных заведений Русской Православной Церкви.

1 апреля 2025 года под председательством наместника Троице-Сергиевой лавры и ректора МДА епископа Кирилла состоялось очередное заседание совета культурно-просветительского центра «Киновия».

На стадионе «Луч» г. Сергиев Посад проходил благотворительный турнир по футболу «Русская весна». Команда МДА приняла участие и заняла второе место.

У спортивно-туристического клуба в честь пророка Божия Илии Московской духовной академии появился свой сайт.

27 марта 2025 года в рамках Ломоносовских чтений МГУ состоялся круглый стол, на котором доцент МДА диакон Сергий Кожухов прочитал доклад на тему «Толкование Ипполита Римского на “Песнь песней” в грузинском изводе».

27 марта 2025 года в Коломенской духовной семинарии состоялась III Всероссийская научно-богословская конференция «Богословская наука в духовной школе», участие в которой принял студент подготовительного курса магистратуры кафедры библеистики МДА Михаил Малютин.

Героем заключительного, четырнадцатого выпуска проекта «Лица Академии 3.0» стал преподаватель кафедры богословия, секретарь ректора Московской духовной академии иеромонах Дамиан (Воронов).

В период с 12 по 13 мая 2025 года кафедра церковной истории МДА проведет VII Всероссийскую научную конференцию «История Церкви: факт и мысль».